[No.H001]
抬頭仰望夜空
群星閃爍
讓人不禁感慨
宇宙的浩瀚和人類(lèi)的渺小
而在星河萬(wàn)物之外
是否存在一種更大的“實(shí)體”
我們認(rèn)知中的宇宙
只是它的某個(gè)細(xì)胞
同樣的,人類(lèi)本身是否也是一個(gè)宇宙?我們體內(nèi)的每一個(gè)細(xì)胞、每一顆原子是否也如行星一般,在人類(lèi)觀察不到的地方閃爍著耀眼的光芒?
幾百年來(lái),人類(lèi)對(duì)于宇宙的探索從未停止,而隨著科技的不斷發(fā)展,宏觀和微觀世界的樣貌也逐漸清晰的展示在我們面前。
不同尺度下的事物似乎具有某些相似性,比如人類(lèi)大腦的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和宇宙網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)有著異曲同工之妙。
當(dāng)然,這樣的想法是沒(méi)有任何科學(xué)依據(jù)的,它們僅僅只是相似而已,宇宙的結(jié)構(gòu)不可能具有基本的生物形態(tài):微觀粒子的運(yùn)動(dòng)和宏觀天體運(yùn)動(dòng)在本質(zhì)上完全不同,微觀運(yùn)動(dòng)與宏觀運(yùn)動(dòng)相比充滿了不確定性和不可預(yù)知性。
也許這個(gè)問(wèn)題還需要一代又一代的天體科學(xué)家們?nèi)ヌ剿�、去發(fā)現(xiàn),而在微觀世界中,也有一群先驅(qū)者在不斷的探索,將一個(gè)小小的“宇宙”還原到我們的面前。
來(lái)自伊利諾伊大學(xué)厄巴納·香檳分校的JCVI研究團(tuán)隊(duì)成功創(chuàng)造出了一個(gè)最小的支原體活細(xì)胞,能夠在計(jì)算機(jī)中模擬全部的物理以及化學(xué)性質(zhì),如同“造物主”一般。
這是迄今為止最復(fù)雜的細(xì)胞模擬過(guò)程,多種多樣的細(xì)胞有著不同的化學(xué)性質(zhì),為了構(gòu)建一個(gè)最小的細(xì)胞,研究人員選擇了最簡(jiǎn)單的支原體細(xì)胞,這種寄生于其他生物體的細(xì)胞相較于其他細(xì)胞所包含的基因數(shù)要少的多,因此也更適合構(gòu)建細(xì)胞模型。
盡管是最簡(jiǎn)單的活細(xì)胞,支原體細(xì)胞內(nèi)也包含20億個(gè)原子,超過(guò)7000個(gè)遺傳信息過(guò)程,只有借助高性能計(jì)算(HPC)才能從原子粒度中模擬細(xì)胞運(yùn)動(dòng)過(guò)程,而能夠支撐如此復(fù)雜的并行算法只有依靠GPU才能實(shí)現(xiàn)。不只是在仿真和建模中,在醫(yī)療、金融、制藥等領(lǐng)域,HPC和GPU加速都可科學(xué)發(fā)展鋪平道路。
對(duì)于戴爾科技來(lái)說(shuō),HPC領(lǐng)域并不陌生,有著領(lǐng)先的技術(shù)理念和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),推出了多款高密度、高性能GPU計(jì)算服務(wù)器,并成立了戴爾科技HPC和AI創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)室,最新一代的PowerEdge服務(wù)器更是HPC服務(wù)器中的佼佼者。
擁有強(qiáng)大GPU加速器優(yōu)化性能的戴爾PowerEdge XE8545服務(wù)器專(zhuān)為高性能AI計(jì)算而生,這款雙插槽4U機(jī)架式服務(wù)器最高支持4塊NVIDIA A100 GPU加速卡,使用業(yè)界領(lǐng)先的NVLink GPU直連設(shè)計(jì),突破數(shù)據(jù)流和計(jì)算能力的界限,輕松滿足AI深度學(xué)習(xí)和高級(jí)計(jì)算等工作負(fù)載。
戴爾PowerEdge XE8545支持PCIe 4.0,增加100%的處理核心數(shù)量,內(nèi)存加速快20%,充分保障并行I/O吞吐性能,提升處理的速度。
JCVI團(tuán)隊(duì)通過(guò)20分鐘的支原體活細(xì)胞模擬,在三維模型中觀察到細(xì)胞的氨基酸與核苷酸的主動(dòng)運(yùn)輸過(guò)程,讓研究員了解到細(xì)胞的生存規(guī)律。除了在原子級(jí)模擬活細(xì)胞外,高性能計(jì)算和GPU加速可以幫助科研人員建立各種復(fù)雜病毒的可視化模型,了解病毒的性質(zhì)并找到攻克病毒的解決方案。
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